Niek Depoorter schloss sein Studium der Rechtswissenschaften (1987–1992) mit einem Master ab. Außerdem erwarb er einen Master in Betriebswirtschaft an der Universität Antwerpen.

Während seiner langen Karriere bei Arvesta hat Niek Depoorter verschiedene Positionen bekleidet. Er begann als Einkäufer/Händler bei Group Aveve (1994–2000) und wurde dann Operations Manager (2000–2003) und anschließend CEO bei Hortiplan (2003–2017).

Zudem war er Operations Manager (2006–2011) und anschließend CEO (2011–2016) bei Sanac. Von 2016 bis 2017 war Niek Depoorter Operations Manager in der BU Agri & Horti von Arvesta und von 2017 bis 2023 BU Director bei Agri & Horti von Arvesta.

Seit 1. Januar 2024 ist Niek Depoorter CEO von Arvesta.